三色旋花通常被认为是无毒的。
在现有的植物毒性研究资料中，并没有发现它含有对人体有害的毒素 ，可以放心将其用于园林景观布置、庭院装饰以及家庭盆栽等。不过，对于部分过敏体质人群，接触三色旋花的花粉或植株时，可能会出现过敏反应，比如皮肤瘙痒、红肿等，一旦出现不适症状，应尽快远离并及时就医。